Ett klipp bestämmer tempot när proteiner bildas
tRNA är cellens leverantör av byggmaterial till de viktiga proteinerna. Hur bra tRNAt fungerar varierar och Fredrik Petterssons avhandling visar en av orsakerna.
- Två tRNAn ska kanske bli likadana, men beroende på vilka nukleotider som sitter i änden kommer de att fungera olika bra i slutändan, säger Fredrik Pettersson.
Det beror på att när tRNAt har bildats med DNA som mall, så är det inte moget.
För att kunna göra sitt jobb och transportera de aminosyror som proteiner består av, skall tRNAt justeras, klippas. Det är här Fredrik Petterssons extrabyggstenar spelar en viktig roll. En viss kombination av byggstenar kan få klippningen att gå långsamt eller snabbt. Klippningen kan också ske på olika sätt, vilket gör att slutprodukten – det mogna tRNAt – blir olika effektivt.
Vissa kombinationer av byggstenar är vanligare än andra. Det gör att forskarna kan använda kombinationerna för att lära sig om bakteriernas evolutionära utveckling och urskilja när en bakteriesort avviker.
Fredrik Pettersson har också sett att stället där DNAt öppnar sig inför att kopiera sig självt verkar ha betydelse. Gener som sitter nära öppningsstället ger statistiskt sett mer tRNA. Det sambandet är något som Fredrik Petterson skulle vilja gå vidare och undersöka närmare.