Kit för ökad effektivitet vid sekvensering av RNA
Kapa Biosystems nya RNA-sekvenseringskit använder en ny metod för att ta bort ribosomalt RNA i prover.
Nu kommer ett nytt Stranded RNA-seq Kit som ska öka effektiviteten vid RNA-sekvensering. Det hela går ut på att minimera mängden ribosomalt RNA, rRNA, som dröjer sig kvar genom provprepareringsprocessen.
För att råda bot på de traditionellt höga mängderna rRNA har kitets tillverkare, Kapa Biosystems, valt att introducera en metod de kallar för Ribo Erase. Med metoden bryts rRNA ned specifikt med hjälp av enzymer och oligos. På det sättet hoppas man att fler låguttryckta och unika transkript ska återfinnas vid RNA-sekvenseringen.
Så mycket som 99,98 procent av allt rRNA kan tas bort. En populär alternativ metod är anrikning av proteinkodande messenger RNA, mRNA, men risken med denna metod är att nya spännande RNA som inte har den traditionella sammansättningen som mRNA missas i RNA-sekvenseringen.
